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Molecular & Cellular Proteomics 14(12):3284-98 (2015) ,以動態磷酸化蛋白體學解析在 ATP 合成酉每 抑制劑 citreoviridin 處理後的細胞及老鼠體內所引發的 磷酸化蛋白之 動態 變化. Ŝ‹ç«‹é«˜é›„大學法律學系研究所 碩士論文 幫助犯的因果關係 Causality of Accessory 研究生:蔡忠廷撰 指導教授:陳子平教授. 專業服務
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Scientific Reports 5:13295 (2015) , 以共調控差異網路成功地運用在不同的生醫研究上。在此研究中,我們運用兩組酵母菌不同基因表現資料所建立的共調控差異網路,利用網路拓樸與功能分析來探討共調控差異網路與其他生物網路有何差異。我們發現共調控差異網路往往形成類似樹狀的網路結構,這與一般所以認知的生物網路結構有很大的不同。另外,我們也發現形成共調控差異的基因,往往是參與不同的反應路徑或功能,並可以從這些共調控差異的基因去推論是哪些調控因子受到擾動所造成的調控差異。我們的分析結果使得共調控差異網路提供了新的研究觀點。. 范德堡大學, 研究,教學和學習融合中心(Center for the Integration of Research, Teaching, and Learning). 黑巧克力有何幫助和壞處? 1 篇名: 黑巧克力有何幫助和壞處? 作者: 陳筱宛 啟英高中 綜高三丙 李葦貞 啟英高中 綜高. BMC Genomics 16(1):41 (2015) , 研究丹參酮 IIA 於胃癌細胞的分子作用機制 。 丹參是一種中國傳統中藥,而丹參酮 IIA 是從丹參中萃取出來的一種二帖類化合物。有許多研究報導指出丹參酮 IIA 具有抗癌的功效,包括抗胃癌。在大部分的腫瘤中,葡萄糖的代謝轉換常常是癌細胞的一個特點,因為它會提供養分使癌細胞增生。截至目前為止,丹參酮 IIA 在胃癌中與葡萄糖代謝的相關分子機制還不清楚 。 在這個研究中 , 我們整合次世代定序轉錄體和定量蛋白體的方法,透過網路生物學與功能性分析,得知丹參酮 IIA 會經由抑制癌細胞的葡萄糖代謝而導致細胞壓力,這樣的壓力包括使癌細胞養分缺乏和 DNA 損害。除此之外,丹參酮 IIA 會使胃癌細胞大量表現 p53 及降低 AKT 表現,致使細胞骨架重組,並使細胞週期停滯於 G 2 /M 期,最終導致細胞凋亡。這個研究結果除可使我們了解丹參酮 IIA 作用於胃癌細胞的分子機制,並可提供癌症治療的發展方針。. 您的問題 :論文撞牆期,問題盤根錯節,無從下手

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5. Array麻省理工學院(英文: Massachusetts Institute of Technology ;縮寫: MIT )為一所坐落於麻薩諸塞州劍橋市的私立 研究型大學。. 阮雪芬老師發表的論文 Integrating transcriptomics and proteomics to show that tanshinone IIA suppresses cell growth by blocking glucose metabolism in gastric cancer cells. 您的問題: 工作、家庭焦頭爛額,學業低空飛過,根本沒時間找文獻

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黑巧克力有何幫助和壞處? 1 篇名: 黑巧克力有何幫助和壞處? 作者: 陳筱宛 啟英高中 綜高三丙 李葦貞 啟英高中 綜高. 主旨:徵聘國立臺灣 大學分子與細胞生物學研究所 所長一名
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任期 : 所長任期一任三年,連選得連任一次

二、申請人資格:
( 一 ) 教授級或副教授級(具部頒教授證書)或相當資格者。
( 二 ) 具與本所分子與細胞生物學中長程發展相關專長者。
( 三 ) 具前瞻性教育理念、學術卓越成就及聲望、高尚品德及行政能力者。

三、申請方式:
( 一 ) 自行申請
( 二 ) 本所所長選任委員會推薦
( 三 ) 本所專任教師二人以上推薦. 學校/系/所: 3. 阮雪芬老師發表的論文 Quantitative proteomics reveals middle infrared radiation-interfered networks in breast cancer cells. Department of Language and Creative Writing(字型為14之Times New Roman、1. 104 學年度音樂系協奏曲比賽 公告日期:中華民國104 年6 月 比賽重要日程: 1. 國立高雄大學法律學系研究所 碩士論文 幫助犯的因果關係 Causality of Accessory 研究生:蔡忠廷撰 指導教授:陳子平教授. 三、影像處理、壓縮與網路資訊防偽之研究
防偽的研究著重於使用數位資料隱藏(Digital Data Hiding ) 或數位浮水印(Digital Watermarking)的方式將文字資訊隱藏於數位圖樣資料。不同於傳統的方式,通常圖樣影像全被微量失真。所研發的方法能將文字資訊隱藏以及在接收時以Lossless的方式還原圖樣影像。同時所發展的演算法也能偵測是否原始影像有被修改而達到真偽辨識的功能。類似方法也被用於二元(Binary)影像數位並達到大隱藏量(Data Hiding Capacity)的效果。所還原的影像不但無失真之虞,而且還原時不需要由原始資料提供加密過程相關的資訊。影像壓縮的研究則偏重於如何壓縮灰階影像以達到最佳壓縮率同時不會產生失真的現象。使用演算法隨機調整預測子(Predictor)由鄰近相子(Pixel)產生時的排列與組成,降低系統的亂度(Entropy)以達成高品質高精確度壓縮效果。
●相關研究計劃:網際網路資訊以數位浮水印展頻與模糊邏輯加密與認証的研究計劃
●相關提出SCI 期刊論文兩篇,會議論文兩篇
 
四、類神經網路與應用
類神經網路的研究主要著重於研發改進非線性雙層類神經網路,例如雙向聯想記憶類的類神經網路(BAM)。BAM 的網路中雖然每一個神經子(Neuron)都是互相關聯的使其成為一個很有效率的類神經網路,但是所面臨的難題則是隨之而來的有限量的樣本儲藏量,知識代表(knowledge Representation)與引射能力(Inference)。使用最小相交演算法(Minimum Overlap Algorithm, MOA)我們可以降低 Hamming 球的大小進而增加分類辨識的分離率(Separability)進而增加BAM 的回想能力(Recall)與樣本的容量,此理論基礎也被推廣到虛數數值的Hopfield。類神經網路得到很正面與有效的成果。類神經網路也被使用於人臉辨識(BPN 方法)以及使用進化演算法進行彩色影像的壓縮(Genetic Algorithm)。
●相關計畫:使用遺傳演算法進行彩色影像壓縮的研究計畫
●發表於SCI的期刊論文一篇,國外期刊一篇
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b. 阮雪芬老師發表的論文 Quantitative proteomics reveals middle infrared radiation-interfered networks in breast cancer cells. 哥倫比亞商學院未來創業領袖培育營 特別公告 : 哥倫比亞大學商學院首次來台開課 > 2016 哥倫比亞大學商學院。.

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報名表Word檔. 聯絡電話:(迅速服務,掌握時效) 6. 您的問題: 工作、家庭焦頭爛額,學業低空飛過,根本沒時間找文獻

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4. BMC Genomics 16(1): 533 (2015) ,研究油菜素類固醇 (BR) 於阿拉伯芥的動態磷酸變化。油菜素類固醇是一種植物激素,調控植物的動態磷酸化分子。在這個研究中,我們整合大規模動態磷酸化蛋白體和生物資訊學的方法,得知不同 BR 反應時間點的過渡生物進程,主要是來自於植物的型態發生及壓力反應。透過磷酸化模組分析,顯示 BR 的初始反應會引起 casein kinase 2 和 mitogen-activated protein kinase 的催化受質分別受到顯著的磷酸化及去磷酸化作用。此外,在我們建構的時依性激酉每 與催化受質相互作用網路中,發現含有其他植物激素的下游信息,如生長素及 ABA 。這個研究結果所發現的磷酸化蛋白及磷酸化位點提供了一個有用的油菜素類固醇訊息調控數據組,可協助我們了解植物磷酸化蛋白質的修飾作用,進而解決植物的生長問題。. 國立高雄大學法律學系研究所 碩士論文 幫助犯的因果關係 Causality of Accessory 研究生:蔡忠廷撰 指導教授:陳子平教授.

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c. 完成期限: 9. 阮雪芬老師發表的論文 Circadian systems biology in Metazoa. Briefings in Bioinformatics 16(6):1008-24 (2015) , 以系統生物學探討在後生動物的生理時鐘 。 系統生物學是一門整合性的科學,比較不同階段的過程可使我們了解複雜的生物系統。生理時鐘存在於體內,會影響各種生理活性,包括改變基因的表現、蛋白質轉換、代謝和人類的行為。我們在這篇文章以系統生物學探討生理控制系統和它相關的基因與蛋白質的關係,進而研究與生理時鐘有關的疾病。. 保存期限
論文完成后 60 天內,若您無其他要求修改, 將把一切論文相關的往來資料及全部檔案銷毀。因此超出保存期限後,若您不慎遺失論文資料, 也愛莫能助。

4. 五、超導超流系統分析與最佳化的研究延續
在超導超流領域27年的研究,近五年的研究偏向於動態的超流體特性分析。雖然高溫超導材料已持續的改善其特性與功能,然而低溫超導材料,尤其是高強度的磁鐵與高性能的超導電子材料仍需要有很有效的低溫冷卻系統以維持其超導的特性。超流體Superfluid Helium 或稱為超流體He II 具有極佳的導熱特性,當He II 溫度降到2度Kelvin 以下時若操作壓力為大於其飽和氣壓則其冷卻效果可以及熱安全的操作範圍可以增。使用加壓的超流體He II 來冷卻大型的超導馬達或機器是一個目前很熱門的課題,尤其是磁浮列車的設計需要對超流體的特性做一個更深入的瞭解研究的主要方向是使用Gorter-Mellink 的超流理論配合實際導體的設計需求而建立系統設計的基本公式與模式。經由正規化無單位的推導(Dimensional Analysis),我們可以歸納分析而建立超流導熱的特性公式。比模組可以被適度的等比例放大而有助於大型超導系統的設計、分析及以系統最佳化的建置。
●相關SCI期刊論文篇,1篇國外期刊論文。
 
六、奈米透明導電薄膜材料
奈米薄膜的導光與導電的特性對於奈米光電的應用與分析有極大的助益。研究方向主要是使用表面增強光譜(Surface-enhanced Raman Scattering, SERS)為工具以瞭解與分析奈米金屬膜,尤其是金與銀與其他基本之前的物性與化性。奈米薄膜的原度通常小於100nm 其物性與化性改變許多,這些特性經由SERS的分析後更能幫助光電與電子元件的設計更深入探討導電與導光的特性進而評估各種薄膜產生流程的優劣特性進而改善奈米薄膜的光電效應的品質。
●相關SCI期刊論文共五篇。. 阮雪芬老師發表的論文 Characterization and functional analysis of differential coexpression networks.

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阮雪芬老師發表的論文 Circadian systems biology in Metazoa. 抽籤當日需繳交保證金500 元,未如期繳交者視同未報名;保證金將於比賽結束後退還,無不可抗力之因素棄權者將沒收保證金。
注意事項: 1. 在期限內指導您完成您原創/版權專屬/質量俱佳的論文,絕對保密 3. 保密協議
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a. 研究工具 (research tools)

c. 您需在全文諮詢指導後 72 小時內提出意見及確認,因確認時間過長而造成延誤, 不承擔責任。
c. 在這個研究中我們鑑定了 829 個磷酸化蛋白並發現 citreoviridin 會影響蛋白質摺疊、細胞週期和細胞骨架的功能。藉由數學模型建構和生物資訊分析發現熱休克蛋白 90β (HSP90AB1) 和絲裂原活化蛋白激酉每 (mitogen-activated protein kinases, MAPK) 的訊息路徑扮演著重要的角色 。 我們首次揭露並釐清 HSP90AB1 Serine 255 調控 MAPK 路徑而抑制細胞的生長,這個發現將能提供抗癌的一個新策略。. 師資質量
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2.   比賽採分組初賽( 鋼琴、弦樂、管擊、聲樂) 、合組複賽方式進行。 4.   報名時間:即日起至104 年9 月18 日下午5 點截止。 3. 專業服務
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5. 國立高雄大學法律學系研究所 碩士論文 幫助犯的因果關係 Causality of Accessory 研究生:蔡忠廷撰 指導教授:陳子平教授.

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7. Journal of Proteome Research 14(2):1250-62 (2015) , 發現中波紅外光會抑制高侵犯性三陰性乳癌細胞的生長,但卻對於正常細胞沒有影響 。 我們運用定量蛋白質體學技術 , 探討中波長紅外光是如何抑制乳癌細胞生長 , 並造成細胞型態改變的分子機制。我們總共鑑定了 1,749 個蛋白質 , 並進一步利用功能性分析及實驗證實 , 中波紅外光會影響微管蛋白在細胞中的排列情形,使得微管組織中心的複製受到阻礙,進而造成乳癌細胞停止在細胞週期 G2/M 階段。此外,中波紅外光改變了細胞貼附蛋白的分布 , 以及肌動蛋白應力纖維收縮的極性,因而使乳癌細胞的爬行與侵襲能力降低。這個成果揭露了中波紅外光於抑制乳癌生長及轉移的作用機制,並顯示其具有潛力用於轉移性乳癌的治療。. 國立高雄大學法律學系研究所 碩士論文 幫助犯的因果關係 Causality of Accessory 研究生:蔡忠廷撰 指導教授:陳子平教授. 比賽優勝同學需提供樂團總譜及分譜,並自行負擔樂團租譜費用。
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c.   參賽者請於9 月21 日(星期一)中午12 點,親自或指派代表至音樂系會議室公開參加抽籤,以決定出賽順序,未出席者視同放棄權利,將由系主任代為抽籤。 5. 阮雪芬老師發表的論文 Temporal phosphoproteome dynamics induced by an ATP synthase inhibitor citreoviridin. 104 學年度音樂系協奏曲比賽 公告日期:中華民國104 年6 月 比賽重要日程: 1. 您需在全文諮詢指導後 72 小時內提出意見及確認,因確認時間過長而造成延誤, 不承擔責任。
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2. Journal of Proteome Research 14(2):1250-62 (2015) , 發現中波紅外光會抑制高侵犯性三陰性乳癌細胞的生長,但卻對於正常細胞沒有影響 。 我們運用定量蛋白質體學技術 , 探討中波長紅外光是如何抑制乳癌細胞生長 , 並造成細胞型態改變的分子機制。我們總共鑑定了 1,749 個蛋白質 , 並進一步利用功能性分析及實驗證實 , 中波紅外光會影響微管蛋白在細胞中的排列情形,使得微管組織中心的複製受到阻礙,進而造成乳癌細胞停止在細胞週期 G2/M 階段。此外,中波紅外光改變了細胞貼附蛋白的分布 , 以及肌動蛋白應力纖維收縮的極性,因而使乳癌細胞的爬行與侵襲能力降低。這個成果揭露了中波紅外光於抑制乳癌生長及轉移的作用機制,並顯示其具有潛力用於轉移性乳癌的治療。. 收到您 50% 第一期款項後, 開始提供諮詢指導服務,期間有任何問題可協議退款。如果不滿意請立即指出。 會商議諮詢指導教授處理問題,若無法在兩星期內給您完整回覆,則協議退費。如完成文獻探討諮詢指導後,才告知論文品質不滿意, 會視為惡意騙稿,不得退款。

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4. 全文諮詢指導後超出 7 天不作任何回應, 會發信提醒。超出 15 天後,將視為惡意騙稿。屆時 將啟動相應措施,以維護諮詢指導教授的權利。  . Transgenic zebrafish model to study translational control mediated by upstream open reading frame of human chop gene. 您的問題: 論文遲遲無法動筆,不知從何動筆

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5. 收費標準:
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指定章節諮詢指導: 00 元起。 – 貳.   比賽採分組初賽( 鋼琴、弦樂、管擊、聲樂) 、合組複賽方式進行。 4.

  演出期程:比賽優勝者音樂會,暫定於105 年上半年於台北市中山堂舉行。
報名方式: 1. 阮雪芬老師發表的論文 Integrating phosphoproteomics and bioinformatics to study brassinosteroid-regulated phosphorylation dynamics in Arabidopsis. 在期限內指導您完成您原創/版權專屬/質量俱佳的論文,絕對保密 3. 研究領域及方向:(以便適配專業領域諮詢指導教授) 5. 抽籤當日需繳交保證金500 元,未如期繳交者視同未報名;保證金將於比賽結束後退還,無不可抗力之因素棄權者將沒收保證金。
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4. Transgenic zebrafish model to study translational control mediated by upstream open reading frame of human chop gene. 五、超導超流系統分析與最佳化的研究延續
在超導超流領域27年的研究,近五年的研究偏向於動態的超流體特性分析。雖然高溫超導材料已持續的改善其特性與功能,然而低溫超導材料,尤其是高強度的磁鐵與高性能的超導電子材料仍需要有很有效的低溫冷卻系統以維持其超導的特性。超流體Superfluid Helium 或稱為超流體He II 具有極佳的導熱特性,當He II 溫度降到2度Kelvin 以下時若操作壓力為大於其飽和氣壓則其冷卻效果可以及熱安全的操作範圍可以增。使用加壓的超流體He II 來冷卻大型的超導馬達或機器是一個目前很熱門的課題,尤其是磁浮列車的設計需要對超流體的特性做一個更深入的瞭解研究的主要方向是使用Gorter-Mellink 的超流理論配合實際導體的設計需求而建立系統設計的基本公式與模式。經由正規化無單位的推導(Dimensional Analysis),我們可以歸納分析而建立超流導熱的特性公式。比模組可以被適度的等比例放大而有助於大型超導系統的設計、分析及以系統最佳化的建置。
●相關SCI期刊論文篇,1篇國外期刊論文。
 
六、奈米透明導電薄膜材料
奈米薄膜的導光與導電的特性對於奈米光電的應用與分析有極大的助益。研究方向主要是使用表面增強光譜(Surface-enhanced Raman Scattering, SERS)為工具以瞭解與分析奈米金屬膜,尤其是金與銀與其他基本之前的物性與化性。奈米薄膜的原度通常小於100nm 其物性與化性改變許多,這些特性經由SERS的分析後更能幫助光電與電子元件的設計更深入探討導電與導光的特性進而評估各種薄膜產生流程的優劣特性進而改善奈米薄膜的光電效應的品質。
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黑巧克力有何幫助和壞處? 1 篇名: 黑巧克力有何幫助和壞處? 作者: 陳筱宛 啟英高中 綜高三丙 李葦貞 啟英高中 綜高

阮雪芬老師發表的論文 Integrating phosphoproteomics and bioinformatics to study brassinosteroid-regulated phosphorylation dynamics in Arabidopsis. Tw ,主旨【( 姓名) 協奏曲比賽報名表】 2. 專業服務
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5.

另請參見:

黑巧克力有何幫助和壞處? 1 篇名: 黑巧克力有何幫助和壞處? 作者: 陳筱宛 啟英高中 綜高三丙 李葦貞 啟英高中 綜高. 阮雪芬老師發表的論文 Characterization and functional analysis of differential coexpression networks.   報名時間:即日起至104 年9 月18 日下午5 點截止。 3. Molecular & Cellular Proteomics 14(12):3284-98 (2015) ,以動態磷酸化蛋白體學解析在 ATP 合成酉每 抑制劑 citreoviridin 處理後的細胞及老鼠體內所引發的 磷酸化蛋白之 動態 變化. Email: 7. 完成期限: 9. 專業服務
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防偽的研究著重於使用數位資料隱藏(Digital Data Hiding ) 或數位浮水印(Digital Watermarking)的方式將文字資訊隱藏於數位圖樣資料。不同於傳統的方式,通常圖樣影像全被微量失真。所研發的方法能將文字資訊隱藏以及在接收時以Lossless的方式還原圖樣影像。同時所發展的演算法也能偵測是否原始影像有被修改而達到真偽辨識的功能。類似方法也被用於二元(Binary)影像數位並達到大隱藏量(Data Hiding Capacity)的效果。所還原的影像不但無失真之虞,而且還原時不需要由原始資料提供加密過程相關的資訊。影像壓縮的研究則偏重於如何壓縮灰階影像以達到最佳壓縮率同時不會產生失真的現象。使用演算法隨機調整預測子(Predictor)由鄰近相子(Pixel)產生時的排列與組成,降低系統的亂度(Entropy)以達成高品質高精確度壓縮效果。
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四、類神經網路與應用
類神經網路的研究主要著重於研發改進非線性雙層類神經網路,例如雙向聯想記憶類的類神經網路(BAM)。BAM 的網路中雖然每一個神經子(Neuron)都是互相關聯的使其成為一個很有效率的類神經網路,但是所面臨的難題則是隨之而來的有限量的樣本儲藏量,知識代表(knowledge Representation)與引射能力(Inference)。使用最小相交演算法(Minimum Overlap Algorithm, MOA)我們可以降低 Hamming 球的大小進而增加分類辨識的分離率(Separability)進而增加BAM 的回想能力(Recall)與樣本的容量,此理論基礎也被推廣到虛數數值的Hopfield。類神經網路得到很正面與有效的成果。類神經網路也被使用於人臉辨識(BPN 方法)以及使用進化演算法進行彩色影像的壓縮(Genetic Algorithm)。
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3. 二、生物辨識系統(Biometric)的特徵擷取,影像處理歸類與辨識
主要的研究方向是以手掌的自動位置確認(ROI Locating),進而進行前置影像處理,再而將影像的特徵擷取以成為建立資料庫的基本資料。基於統計理論與人工智慧(AI)的機制建立掌紋辨識的模式以利非堅督式的(Unsupervised)學習而能達到高精確度的辨識系統使用者的身分。除了掌紋的辨識之外,人臉、辨識也是研究的主題之一。旨在研發一套智慧型的人臉擷取與辨識的系統以利取款機(ATM)安全監控(Surveillance)門禁管制系統的應用,使用工具為傳統與新創的影像確認擷取,影像處理去雜訊與正規化,影像分類模組的建立。模組的訓練與測試演練法的研究等。
●相關計劃:“使用人體特徵作為智慧型身分辨識與門禁管制的策略與演算法”,93年國科會計劃
●提出相關SCI期刊論文:兩篇
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阮雪芬老師發表的論文 Quantitative proteomics reveals middle infrared radiation-interfered networks in breast cancer cells

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1. Visual C++ programming language to develop a pull. Scientific Reports 5:13295 (2015) , 以共調控差異網路成功地運用在不同的生醫研究上。在此研究中,我們運用兩組酵母菌不同基因表現資料所建立的共調控差異網路,利用網路拓樸與功能分析來探討共調控差異網路與其他生物網路有何差異。我們發現共調控差異網路往往形成類似樹狀的網路結構,這與一般所以認知的生物網路結構有很大的不同。另外,我們也發現形成共調控差異的基因,往往是參與不同的反應路徑或功能,並可以從這些共調控差異的基因去推論是哪些調控因子受到擾動所造成的調控差異。我們的分析結果使得共調控差異網路提供了新的研究觀點。. 抽籤當日需繳交保證金500 元,未如期繳交者視同未報名;保證金將於比賽結束後退還,無不可抗力之因素棄權者將沒收保證金。
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2 Comments

  1. Andreas
  2. Robert

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